Gracias al bicampeonato de América accedió nuevamente a la Intercontinental, otra vez con el Inter de Milán. Por ello, este experto valora el gran avance alcanzado en este campo gracias a los navegadores intracardíacos ya que, en su opinión, “han constituido, sin duda, la gran revolución de la arritmología moderna”. En este rubro el referente era el arquero Fernando Bello, que por mucho tiempo fue también el arquero titular de la Selección Argentina. Gol 100: Fernando Soriano – Real Madrid 4-2 U.D. ↑ «La curiosa anécdota sobre por qué el Atlético de Madrid y el Athletic de Bilbao visten de rojiblanco». ↑ «Zalazar, José Luis Zalazar Rodríguez – Futbolista». A partir de la jornada 6 el Almería levanta el vuelo, la idea de fútbol de José Gomes, sus sorprendentes rotaciones y la garra mostrada por los jugadores lleva al equipo indálico a cosechar una gran racha de resultados que le hacen encaramarse a los puestos altos de la clasificación, ocupando incluso en múltiples jornadas puestos de ascenso directo. Para mediados de la década de 1970 era ya asiduo ver a jugadores no vizcaínos en el equipo. El arranque de la década fue a lo grande, saliendo campeón del Metropolitano 1970 tras vencer como visitante al clásico rival Racing Club por 3-2, en un partido donde estaba obligado a ganar para no quedar segundo.
Para el partido de revancha en Avellaneda, con 80.000 hinchas rojos, Independiente pudo haber triunfado por un gol para ir al partido desempate, dado que se jugaba por puntos. En el campeonato de Primera alcanzó el segundo lugar y hubo muchas victorias por goleada entre ellas: 8-1 contra Estudiantes de La Plata, 5-0 a Vélez Sarsfield, y las dos más destacadas; el 7-1 a Boca Juniors (siendo ésta la mayor goleada sufrida por los xeneizes en su historia), y la mayor goleada histórica del clásico de Avellaneda, el 7-0 contra Racing Club. En la mencionada instancia se cruzó con un clásico rival; Boca Juniors. Teniendo el mejor ataque del campeonato con 61 goles, Independiente finalizó el torneo en la segunda posición detrás de Boca Juniors. Otra vez arrancando en segunda fase como campeón defensor, Independiente compartió grupo con River Plate, Boca Juniors y Guaraní. Aún llamada Copa de Campeones, Independiente demostró allí un juego muy contundente; en primera fase compartió grupo con Millonarios de Colombia y Alianza Lima, a quienes goleó de local por 5-1 y 4-0 respectivamente.
Con ello clasificó a la Copa Libertadores 1968, donde alcanzó la segunda fase. Como campeón defensor, clasificó directamente a las semifinales de la copa en 1965, ya renombrada como Copa Libertadores de América. En la Copa de Campeones de América 1961, disputada por solamente nueve equipos campeones de su país, quedó eliminado en cuartos de final tras caer con doble derrota con el Palmeiras. Con el primer título de campeón de América en sus manos, Independiente accedió a disputar por primera vez la Copa Intercontinental, que definía al mejor equipo del mundo contra el campeón de Europa. De la Mata, Zorrilla, y Érico fueron los goleadores de la segunda copa internacional. En 1950 se retiró Vicente de la Mata, el último de los grandes goleadores de Independiente de las últimas dos décadas. Di Stéfano contaba que de chico era fanático de la delantera de Erico, Sastre y De la Mata, agregando incluso que Arsenio Erico fue el mejor jugador que vio jugar alguna vez.
En 1946 se fue Arsenio Erico a Nacional de Paraguay, su club de origen. Dentro de este mismo organismo, en 1925 el catalán Enrique Gavaldá, quien fuera portero del España, fundó y fue el primer presidente del Colegio Nacional de Árbitros. Independiente comenzó ganando la final de ida con un gol tardío de Raúl Bernao, y en la vuelta cayó 3-1. Se jugó el partido de desempate en el Estadio Nacional de Chile donde Independiente goleó por 4-1; goles de Bernao, Roque Avallay, Osvaldo Mura y un gol en contra. Nuevamente en el estadio San Siro, como se lo conoce popularmente, el Nerazzuri de goleó a Independiente por 3-0 ante 75.000 espectadores, donde el Inter ya se había puesto en ventaja a los 3 minutos de empezado el partido. En las semifinales se midió ante el Athletic Club de Bilbao ganando 2-0 y pasó a la final contra el Real Madrid. Por un lado, logró una goleada histórica en la Copa de la UEFA al ganar por 1-7 al Standard Lieja, cayendo después eliminado en dieciseisavos ante el Austria de Viena. El Club tiene federados dos equipos en la categoría de juveniles el Juvenil A, que participa en la División de Honor Juvenil y en la Copa del Rey Juvenil y el Juvenil B, que juega las competiciones provinciales.